Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms