Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PKHD1P08F94 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PKHD1P08F94 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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PKHD1P08F94 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PKHD1P08F94 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PKHD1P08F94 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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PKHD1P08F94 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
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