Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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