Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEDD8-MDP1E9PL57 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms