Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVV-2B6SEH9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVV-2B6SEH9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms