Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCCD1A6NED2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms