Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms