Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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HDGFL3Q9Y3E1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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