Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC8Q9Y2L5 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms