Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms