Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms