Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTSFQ9UBX1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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