Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC87Q9NVE4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms