Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LMBRD1Q9NUN5 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms