Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ABCC13Q9NSE7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms