Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SERINC1Q9NRX5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SERINC1Q9NRX5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms