Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CIPCQ9C0C6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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