Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLVAPQ9BX97 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms