Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms