Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HINFPQ9BQA5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms