Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PRPF18Q99633 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRPF18Q99633 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PRPF18Q99633 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRPF18Q99633 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRPF18Q99633 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PRPF18Q99633 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRPF18Q99633 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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