Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ALPK3Q96L96 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ALPK3Q96L96 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ALPK3Q96L96 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ALPK3Q96L96 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ALPK3Q96L96 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ALPK3Q96L96 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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