Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG3Q96JB2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms