Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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ECHDC3Q96DC8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ECHDC3Q96DC8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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