Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LMO3Q8TAP4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LMO3Q8TAP4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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