Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM71DQ8N9W8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM71DQ8N9W8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms