Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZIC4Q8N9L1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms