Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM48Q8IWZ4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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