Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms