Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LLGL2Q6P1M3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LLGL2Q6P1M3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms