Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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RTL6Q6ICC9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL6Q6ICC9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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