Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms