Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGSM1Q2NKQ1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGSM1Q2NKQ1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGSM1Q2NKQ1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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