Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RTL8BQ17RB0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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