Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CA9Q16790 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CA9Q16790 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CA9Q16790 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CA9Q16790 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CA9Q16790 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms