Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC18A3Q16572 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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