Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms