Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TUBA3CQ13748 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TUBA3CQ13748 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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