Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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