Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PPP1R1AQ13522 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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