Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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