Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XRCC4Q13426 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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