Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
SCGB2A2Q13296 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SCGB2A2Q13296 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms