Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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