Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NIPAL4Q0D2K0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms