Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RBBP4Q09028 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms