Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms