Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms