Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDE4DQ08499 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms