Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms